2013年学校获批服务国家特需教育硕士人才培养项目，电子信息与电气工程学院开始招收学科教学（物理）教育硕士研究生，2018年学院获批电子与通信工程专业硕士学位点（工程硕士），2019年开始招生，后随着国务院学位委员会专业学位类别调整和优化，电子与通信工程学位点调整为电子信息专业硕士学位点（0854），目前有光电技术及应用、半导体光电材料及应用、智能控制与信息系统三个稳定的特色方向。现有导师36人，其中校内导师20人，校外实践导师16人，现有学生65人。2位导师担任兰州大学、陕西师范大学等高校的博士研究生导师，校外实践导师具有正高级职称的占比达到85%。目前有稳定的联合培养基地3个，其中华天电子科技集团为省级研究生联合培养示范基地。
学院瞄准天水华天电子科技集团、甘肃省电器科学研究院、天水电气传动研究所（国家重点实验室）等企业的技术创新需求，成功申报科技厅重点研发计划、教育厅产业支撑引导、揭榜挂帅等重点项目5项，获批各级各类其他项目29项，到账科研经费1000余万元。2021年获批甘肃省全固态激光工程研究中心、甘肃省高校集成电路产业发展研究院和微电子产业学院；2022年获批集成电路封装测试教育部工程中心。学院积极参与华天电子科技集团、华天传感器等华天集团旗下企业开展技术攻关、产品研制、专利申报等工作，学院导师自主研发的高精度智能烘箱控制器，已经装配于华天电子科技集团生产的高端烘箱，且在封装测试类企业得到了推广及应用，创造了可观的经济效益，产品达到了国内先进水平。
硕士研究生学位点获批以来，研究生导师共计主持国家重点研发计划子项目1项，国家自然科学基金项目18项，省厅级项目60余项，横向课题300 余万，获省级以上奖励6项。研究生发表核心以上高水平论文11篇。学院共完成了两届硕士研究生的招生培养工作（学科教学（物理）、电子信息各一届），2019年招收1人，生师比为0.2；2020年招收12人，生师比为0.8；2021年招收17人，生师比为0.7；2022年招收36人，生师比为1.0。生源来自全国24个省份的统招生源，2022年就业率100%，毕业学生考取知名院校博士研究生。